在南京，缴纳公积金和社保的流程如下：
公积金缴纳流程
用人单位在南京市住房公积金管理中心登记，获取单位公积金账号。
新入职员工在单位公积金账号下开设个人公积金账户，通常由单位代为办理。
单位和个人按照规定的比例缴纳公积金，南京市规定单位缴纳比例为8%，个人缴纳比例为8%，合计16%。
员工在满足一定条件后，可以申请提取公积金用于购房、租房、还贷等用途。
社保缴纳流程
单位社保缴纳
与开户银行签订借记合同、授权书，办理银行托收业务。
查询当月应交数据，在10日前转账至社保费账户，25日前服务大厅打印收据。
查询当月应交数据，5-8日到地税局打印《税款专用缴款书》后缴费。
个人社保缴纳
关注“南京社保”，点击“我的社保”进行自助缴费。
打开支付宝“城市服务”，找到“灵活就业人员缴费”，完成社保信息查询和缴费。
绑定银行卡，每月26日至月底，银行将自动从缴费卡中代扣应缴的社会保险费。
灵活就业参保人员持身份证和社会保障卡，在建设银行任一营业网点办理现金缴纳。
注意事项
灵活就业人员可以在全市中国建设银行、中国农业银行、中国工商银行、中国邮政储蓄银行、南京银行、中国银行、溧水农商行各营业网点办理缴费。
灵活就业人员还可以通过“我的南京”APP或微信小程序“江苏税务社保缴纳”进行缴费操作。
以上信息根据最新发布的政策整理而来，具体流程和比例可能会有更新，请以官方最新发布的政策为准。