有两个孩子要离婚时，可以通过以下两种主要方式来处理：
双方都同意离婚，并对财产分割、子女抚养等问题达成一致意见。
填写离婚协议书，并准备好结婚证、身份证、户口本等相关证件，到一方户口所在地的婚姻登记机关申请离婚登记。
如果一方不同意离婚或双方无法达成协议，可以向人民法院提起离婚诉讼。
准备起诉状、户口本、身份证、结婚证及相关证据材料，到法院立案。
法院审理离婚案件，首先进行调解；如果感情确已破裂，调解无效，则准予离婚。
子女抚养权的判定：
两周岁以下的子女：一般随母方生活，除非母亲存在特殊情况（如健康问题、无法履行抚养义务等），可由父亲抚养。
两周岁以上的子女：父母双方应首先通过协议决定抚养权；若无法达成一致，法院将根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。
八周岁以上的子女：法院会尊重孩子的真实意愿，但并非孩子可以随意选择，通常在父母双方条件相当且都争取抚养权的情况下，才会考虑孩子的意见。
建议：
协商优先：如果双方能够心平气和地协商，达成一致意见，协议离婚是最快捷、成本最低的方式。
准备充分：无论是协议离婚还是诉讼离婚，都应准备好相关证件和证据材料，以便顺利进行程序。
法律咨询：在离婚过程中，建议咨询专业律师，了解相关法律规定和诉讼程序，以维护自身权益。
通过以上步骤和注意事项，夫妻双方可以更加合理、合法地处理离婚及子女抚养问题。