夫妻户口不在一起时，可以通过以下方式办理离婚：
双方可以携带身份证、户口本、结婚证和离婚协议书，到任一方当事人的户籍所在地民政机关办事大厅，申请办理离异手续，开具离婚证书。
若双方无法达成协议，任何一方都可以向对方户籍所在地的法院提起离婚诉讼。若被告的住所地与其经常居住地不一致，则可以向被告经常居住地的人民法院提起诉讼。
建议
协议离婚：双方若能够就离婚事宜达成一致，选择协议离婚较为简便快捷。
诉讼离婚：若一方不同意离婚或双方无法达成协议，则需通过法院诉讼解决，此过程可能较为复杂且耗时较长。
无论选择哪种方式，都需要确保相关证件齐全，并按照法定程序办理离婚手续，以确保离婚的合法性和有效性。